Actualmente, o i2A integra seis laboratórios de I&D:
LBA-Laboratório de Biomecânica Aplicada
LABINSAÚDE-Laboratório de Investigação em Ciências Aplicadas à Saúde
LACED-Laboratório de Computação de Elevado Desempenho
SISUS-Laboratório de Soluções Industriais Sustentáveis
VALOREN-Laboratório de Valorização de Recursos Endógenos e Naturais
